Publications
NFDI4Microbiota – national research data infrastructure for microbiota research
Konrad U. Förstner, Anke Becker, Jochen Blom, Peer Bork, Thomas Clavel, Marius Dieckmann, Alexander Goesmann, Barbara Götz, Thomas Gübitz, Franziska Hufsky, Sebastian Jünemann, Marie-Louise Körner, Manja Marz, Ulisses Nunes Da Rocha, Jörg Overmann, Alfred Pühler, Dietrich Rebholz-Schuhmann, Alexander Sczyrba, Jens Stoye, Justine Vandendorpe, Thea Van Rossum, Alice McHardy
Research Ideas and Outcomes9, (2023).
https://doi.org/10.3897/rio.9.e110501
Metagenome-assembled genomes indicate that antimicrobial resistance genes are highly prevalent among urban bacteria and multidrug and glycopeptide resistances are ubiquitous in most taxa
Stefanía Magnúsdóttir, Joao Pedro Saraiva, Alexander Bartholomäus, Majid Soheili, Rodolfo Brizola Toscan, Junya Zhang, CLUE-TERRA consortium, Ulisses Nunes da Rocha
Frontiers in Microbiology14, (2023).
https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1037845
The media composition as a crucial element in high-throughput metabolic network reconstruction
Benedict Borer, Stefanía Magnúsdóttir
Interface Focus13, (2023).
https://doi.org/10.1098/rsfs.2022.0070
Enhanced cultured diversity of the mouse gut microbiota enables custom-made synthetic communities
Afrizal Afrizal, Susan A.V. Jennings, Thomas C.A. Hitch, Thomas Riedel, Marijana Basic, Atscharah Panyot, Nicole Treichel, Fabian T. Hager, Erin Oi-Yan Wong, Birger Wolter, Alina Viehof, Alexandra von Strempel, Claudia Eberl, Eva M. Buhl, Birte Abt, André Bleich, René Tolba, Lars M. Blank, William W. Navarre, Fabian Kiessling, Hans-Peter Horz, Natalia Torow, Vuk Cerovic, Bärbel Stecher, Till Strowig, Jörg Overmann, Thomas Clavel
Cell Host & Microbe, (2022).
https://doi.org/10.1016/j.chom.2022.09.011
Next steps after 15 stimulating years of human gut microbiome research.
Thomas Clavel, Hans-Peter Horz, Nicola Segata, Maria Vehreschild
Microbial Biotechnology15, 164–175 (2022).
https://doi.org/10.1111/1751-7915.13970
Rückmeldung der lebenswissenschaftlichen Nationalen Forschungsdateninfrastrukturen NFDI4Health, GHGA und NFDI4Microbiota zu den Positionen und Empfehlungen des Wissenschaftsrats – Digitalisierung und Datennutzung für Gesundheitsforschung und Versorgung.
Juliane Fluck (ZB MED) und Iris Pigeot (BIPS) in Vertretung für das NFDI-Konsortium NFDI4Health, Oliver Stegle (DKFZ) und Oliver Kohlbacher (UB Tübingen) in Vertretung für das NFDI-Konsortium GHGA, Konrad Förstner (ZB MED) und Alice McHardy (HZI) in Vertretung für das NFDI-Konsortium NFDI4Microbiota, für das NFDI-Direktorat York Sure-Vetter (Direktor NFDI).
ZB MED PUBLISSO, (2022).
https://dx.doi.org/10.4126/FRL01-006434341